نگهداری زرشک خشک شرایط خاصی دارد. عدم رعایت این شرایط موجب فساد زرشک و غیرقابل استفاده شدن آن می شود. زرشک خشک نباید در معرض نور آفتاب و گرما قرار بگیرد همین طور باید رطوبت زرشک کنترل شود در صورتی که زرشک در دمای و رطوبت بالا باعث ایجاد کرم و فساد زرشک می شود در این زمان دیگر زرشک قابل استفاده نیست. در صورتی که زرشک را در دمای خیلی پایین تر دمای محیط نگهداری کنیم باعث خرد شدن دانه زرشک می شود که از لحاظ ظاهری شکل خوبی نخواهد داشت و از کیفیت زرشک کاسته می شود. در صورت دمای بالا و رطوبت بالا زرشک تیره می شود تا این که کاملا به رنگ قهوه ای در می آید و طعم آن تلخ می شود و دیگر قابل استفاده نخواهد بود.
