استفاده از زرشک به مقدار متوسط باعث بروز عوارض نمی شود اما زیاده روی در مصرف آن باعث بروز مشکلاتی مانند اسهال، خون ریزی از بینی، سر گیجه، تهوع، گیجی و مشکلات کلیوی می شود. علائم نشان دهنده ی مشکل کلیه  وجود خون در ادرار، کمر درد، معده درد و دفع ادرار دردناک است.

مصرف بربرین برای خردسالان مناسب نیست. زرشک می تواند سبب آسیب کبدی به آنها و تشدید زردی آنها شود.

زرشک در زنان باردار میتواند باعث ایجاد انقباضات رحم و سقط جنین شود.

استفاده از زرشک برای زنان شیر ده نیز توصیه نمی شود چون اثرات آن میتواند به نوزاد از طریق شیرمنتقل شود.

افرادی که بیماری خاصی دارند و یا از داروهای خاصی استفاده می کنند برای مصرف زرشک باید با پزشک خود مشورت کنند.